15-35. ネアンデルタール人のDNAは、コロナの(重症化)リスクを高める因子のようだ。

「Nature News and Views」の2020年10月26日版に、「ネアンデルタール人のDNAは、COVID-19の(重症化)リスク因子の複雑さに、最も興味を掻き立てさせる。」 という解説記事が出ましたので報告します。先にご紹介した特別企画「なんと!血液型の違いでコロナの重症化度が変わるそうだ!」では、血液型O型は コロナの重症化リスクが低いとの研究結果だったので、O型の当ガラパゴス史観は安心していたのですが、ネアンデルタール人のDNAのある配列を受け継いでいる人は 重症化リスクが高いとの研究結果になりました。ネアンデルタール度が極めて高い当ガラパゴス史観は、このDNA配列を持っている確立も高いかもしれません。 現在の研究結果では、日本人は配列を持っている確立は低いそうです。日本やアジア人にコロナ感染率や死亡率が低い「ファクターX」は このネアンデルタールDNAの特殊配列を持っている確立が低いことが要因の1つかもしれませんね。
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Neanderthal DNA highlights complexity of COVID risk factors

Nature 587, 552-553 (2020)
doi: 10.1038/d41586-020-02957-3
A genetic analysis reveals that some people who have severe reactions to the SARS-CoV-2 virus inherited certain sections of their DNA from Neanderthals. However, our ancestors can’t take all the blame for how someone responds to the virus. A key part of tackling COVID-19 is understanding why some people experience more-severe symptoms than do others. Earlier this year, a segment of DNA 50,000 nucleotides long (corresponding to 0.002% of the human genome) was found to have a strong association with severe COVID-19 infection and hospitalization1. Writing in Nature, Zeberg and Paabo report that this region is inherited from Neanderthals. Their results not only shed light on one reason that some people are more susceptible to severe disease, but also provide insights into human evolutionary biology.

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重要な部分の訳文を紹介しますので、より詳しく知りたい方は原文及び参照論文をどうぞ!

  遺伝子解析により、SARS-CoV-2ウイルスに対して重度の反応を示す一部の人々は、ネアンデルタール人からDNAの「特定のセクション」を継承していることが 明らかになりました。しかし、私たちの祖先は、誰かがウイルスにどのように反応するかについてすべての責任を負うことはできません。 COVID-19に取り組む上で重要なことは、一部の人が他の人よりも重度の症状を経験する理由を理解することです。
  今年の初めに、50,000ヌクレオチド長のDNAセグメント(ヒトゲノムの0.002%に相当)が、重度のCOVID-19感染と入院と強い関連があることがわかりました。 Natureの報告ですが、ZebergとPaaboは、このセグメントがネアンデルタール人から受け継がれていると報告しています。 彼らの結果は、一部の人々が重篤な疾患にかかりやすいという1つの理由を明らかにするだけでなく、人間の進化生物学への洞察も提供します。
  現代のヒトゲノムの約1〜4%は、この古代の親類に由来しています。 生き残った古風な遺伝子の多くは現代人に有害であり、 不妊症と病気のリスクの増加に関連しています。しかし、いくつかは有益です。 例としては、現代のチベット人が非常に高い高度での生活に対処するのを助ける EPAS1と呼ばれるデニソワ人由来の遺伝子(当記事 15-21. デニソワ人との交配で獲得されたらしいチベット人の高高地適応)や、 痛みに対する感受性を高めたり、他にはウイルスの攻撃ををかわすのを助けたりするネアンデルタール人遺伝子があります。
  COVID-19リスクハプロタイプが私たちの古代の親戚から導入された可能性があるかどうかを調査するために、ZebergとPaaboはこの地域を世界中の古風なゲノムの オンラインデータベースと比較しました。彼らは、この地域が約5万年前に現代のクロアチアに住んでいたネアンデルタール人のゲノムと密接に関連していることを発見しましたが、 既知のデニソワ人のゲノムとは関連していませんでした。著者らは次に、現代の人間集団におけるネアンデルタール人由来のハプロタイプの有病率をチェックしました。 彼らは、それが東アジア人とアフリカ人ではまれであるか、完全に存在しないと報告しています。 ラテンアメリカ人とヨーロッパ人の間では、 リスクハプロタイプは適度な頻度で維持されています(それぞれ4%と8%)。 対照的に、ハプロタイプは南アジアの祖先を持つ個人で30%の頻度で発生し、 バングラデシュの遺産を持つ個人では37%に達します。
  したがって、研究者らは、ネアンデルタール人由来のハプロタイプが特定のグループにおけるCOVID-19リスクの実質的な原因であると推測しています。 彼らの仮説は、英国国家統計局の病院データによって裏付けられています。これは、バングラデシュ出身の個人がCOVID-19で死亡する可能性が一般人口の 2倍であることを示しています(他の危険因子はありますが) もちろん、これらの統計に貢献します。
  なぜこのハプロタイプが一部の集団で保持されているのですか?著者らは、それが他の古代の病原体に対して保護的である可能性があり、 したがって世界中の特定の集団で積極的に選択されていると考えています。しかし、個人がSARS-CoV-2コロナウイルスに感染すると、 これらの古代の遺伝子によって媒介される防御免疫反応が過度に攻撃的になり、重度のCOVID-19症状を発症する人々に見られる致命的な免疫反応につながる可能性があります。 その結果、過去に生存に有益であったかもしれないハプロタイプが、今では悪影響を及ぼしている可能性があります。

参考文献の1つの図をご紹介します。

  この図は極めて興味深い図です。解剖学的現代人類で最もデニソワ人の遺伝子を受け継いでいると報告されているのが ニューギニアやオーストラリア等のメラネシアの人々です。予想通り彼らにはある程度の今回のDNA配列があるようです。 デニソワ人はネアンデルタール人の地方型というのが最新の見解なので、当然彼らにDNA配列が受け継がれていてもおかしくはないのです。 しかし南アジアの人々は、特にネアンデルタール度が高いわけではありません。つまりネアンデルタール度の問題ではなく、 どのDNA配列を受け継いでいるか?ということだと思われます。
  ネアンデルタール度の高い当ガラパゴス史観ですが、このDNA配列を受け継いでさえいなければO型なので安心なのですが.....。

この解説記事が参照した参考文献です。
1. The Severe Covid-19 GWAS Group. N. Engl. J. Med. 383, 1522?1534 (2020).
2. Zeberg, H. & Paabo, S. Nature 587, 610?612 (2020).
3. Green, R. E. et al. Science 328, 710?722 (2010).
4. Sankararaman, S. et al. Nature 507, 354?357 (2014).
5. Huerta-Sanchez, E. et al. Nature 512, 194?197 (2014).
6. Zeberg, H. et al. Curr. Biol. 30, 3465?3469 (2020).
7. Enard, D. & Petrov, D. A. Cell 175, 360?371 (2018).
8. Public Health England. Disparities in the Risk and Outcomes of COVID-19 (PHE Publs, 2020).
9. Browning, S. R., Browning, B. L., Zhou, Y., Tucci, S. & Akey, J. M. Cell 173, 53?61 (2018).
10. The 1000 Genomes Project Consortium. Nature 526, 68?74 (2015).
以上



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